A anestesiologia é uma das especialidades médicas sem pré-requisito, ou seja, acesso direto, com carga semanal de 60 horas e duração do curso de 3 anos, com quatro vagas oferecidas anualmente. O residente dispõe da estrutura do Hospital Universitário de Londrina (HU), composto por sete salas cirúrgicas, hemodinâmica, tomografia, centro de queimados, endoscopia e ultrassonografia. 

A residência em clínica médica da UEL possui carga horária de 60 horas semanais, tem duração de dois anos e são oferecidas 16 vagas anualmente. As atividades são realizadas na enfermaria, pronto socorro e ambulatório e envolvem os estágios de pronto socorro, clínica médica, cardiologia, nefrologia, hematologia, reumatologia, moléstias infecciosas, UTI, pneumologia, gastroenterologia, oncologia, cuidados paliativos, psiquiatria, dermatologia, endocrinologia e neurologia. O programa também oferece atividades teóricas e plantões noturnos. São aproximadamente 16 estágios por ano e cada um dura cerca de 20 dias.

A residência em dermatologia da UEL possui carga horária semanal de 60 horas, duração de três anos, são oferecidas três vagas anualmente e costuma ser a residência mais concorrida. Os três anos envolvem atividades na dermatologia clínica, cirúrgica e estética, os residentes realizam acompanhamentos na enfermaria do Hospital Universitário e atividades ambulatoriais específicas, como psoríase, leishmaniose, atividades em conjunto com a reumatologia, mapeamento corporal, hanseníase, cosmiatria e ambulatório geral. O programa também conta com aulas teóricas e práticas de micologia, aulas teóricas de patologia, discussão de aulas de cirurgia, anatomia e técnica cirúrgica, discussão de artigos científicos e casos clínicos. Como diferencial se tem o grande volume de cirurgias, como biópsias e bleferoplastia, enxertos e estéticas.

A residência médica em infectologia oferecida pela UEL tem duração três anos, oferece duas vagas anuais, carga horária semanal de 60 horas e conta com oito docentes muito conceituados. As atividades ocorrem no Hospital Universitário de Londrina, Ambulatório de especialidades do Hospital Universitário, laboratório de microbiologia e imunologia do HU, Centro de controle de infecções hospitalares do HU e no hospital do câncer de londrina. 

A Residência de Medicina de Família e Comunidade oferecida pela UEL tem carga horária semanal de 60 horas, duração de 2 anos e são oferecidas seis vagas anualmente. As atividades são na maior parte do tempo voltadas para Atenção Primária a Saúde, com preceptoria ombro a ombro em tempo integral, agregando atendimentos de promoção e prevenção a saúde, diagnóstico, tratamento, reabilitação, vigilância em saúde e cuidados paliativos. 

A residência de neurocirurgia oferecida pela UEL tem carga horária de 60 horas semanais, duração de cinco anos e oferece uma vaga anualmente. Durante o primeiro ano as atividades são realizadas com a neurologia e envolvem visitas a enfermaria, atendimentos em urgência no pronto socorro e ambulatórios de dor, acidente vascular cerebral, Parkinson, esclerose múltipla e epilepsia.

O programa de residência em Neurologia oferecido pela UEL oferece duas vagas anualmente, tem duração de três anos e é de acesso direto. As atividades teóricas envolvem aulas sobre temas diversos da neurologia com os docentes, de forma presencial no HC e no HU ou de forma remota via reunião online e discussões de artigos científicos nas dependências do CCS no  HU. Já as atividades práticas estão divididas em atendimento aos pacientes neurológicos, seja ele de caráter ambulatorial (no HC) ou de urgência/emergência (no HU).

A residência de Obstetrícia e Ginecologia tem duração de 3 anos, carga horária de 60 horas semanais e são oferecidas 10 vagas anualmente. As atividades são divididas entre a enfermaria no HU, horários cirúrgicos, Maternidade Municipal de Londrina, Maternidade de alto risco do HU e os ambulatórios das subespecialidades (Obstetrícia e Ginecologia). 

A Ortopedia e Traumatologia é uma residência médica de acesso direto, duração de três anos, carga horária semanal de 60 horas e são oferecidas quatro vagas anualmente. É uma residência médica que apresenta duas vertentes a Ortopedia e a Traumatologia, tendo um campo de atuação bastante amplo. Os residentes do primeiro ano ficam focados na Traumatologia, desempenhando atividades principalmente no HU. Já os residentes do segundo ano começam o contato com a Ortopedia, desempenhando atividades tanto no HU como no AEHU (ambulatório de especialidades como coluna vertebral, ombro e cotovelo, quadril, joelho e tornozelo e pé). 

O programa de residência médica em oftalmologia oferecido pela UEL tem duração de três anos, carga horária de 60 horas semanais e oferece duas vagas anualmente. As atividades envolvem o ambulatório no HC, sendo que cada período tem uma especialidade (glaucoma, retina, plástica ocular, infantil e córnea). Cerca de 2 ou 3 períodos são reservados para cirurgia, as cirurgias mais comuns são de catarata e pterígio, mas também é realizado transplante de córnea, estrabismo, alterações de canal lacrimal e de pálpebra. 

A residência em pediatria é uma área de acesso direto, com duração de três anos e são oferecidas dez vagas anualmente. As atividades do primeiro ano de residência em pediatria envolvem atendimentos no pronto-socorro, maternidade, enfermaria, ambulatórios de pediatria geral, neuropediatria e infectologia pediátrica e puericultura em Unidades Básicas de Saúde. No segundo ano da residência as atividades envolvem mais as especialidades da área, como o ambulatório de gastroenterologia, pneumologia e cardiologia pediátrica.

A residência em patologia oferecida pela UEL possui carga horária de 60 horas semanais, duração de três anos e oferece apenas uma vaga anualmente. As atividades do programa envolvem necrópsias, exames histopatológicos, como macroscopia e histopatologia de biopsias e peças cirúrgicas.

A residência de otorrinolaringologia oferecida pela UEL tem carga horária de 60 horas semanais, duração de três anos e são oferecidas duas vagas anualmente. As atividades envolvem consultas ambulatoriais, cirurgias, pronto socorro e enfermaria e ocorrem no Hospital Universitário e no HC.

Psiquiatria é a área da medicina especializada em prevenir, diagnosticar e tratar doenças e transtornos relacionados ao comportamento e sentimentos de seres humanos. O programa de residência médica em psiquiatria oferecido pela UEL é acreditado pela Associação Brasileira de Psiquiatria e credenciado na Comissão Nacional de Residência Médica e no Ministério da Educação. Oferece três vagas anualmente, tem duração de três anos e carga horária semanal de 60 horas. As atividades do programa são exercidas tanto no Hospital Regional Norte do Paraná, quanto no Ambulatório de Especialidades do Hospital de Clínicas, e no primeiro as atividades envolvem interconsultas a pacientes de hospital geral e internações psiquiátricas em quadros agudos graves, além do desenvolvimento passado e presente de projetos e pesquisa com pacientes do centro de queimados.

O programa de pré-requisito em área cirúrgica básica oferecido pela UEL tem carga horária semanal de 60 horas, duração de dois anos e são oferecidas sete vagas anualmente. As atividades envolvem plantões noturnos no pronto socorro cirúrgico e no primeiro ano são voltadas a cirurgia vascular, do aparelho digestivo, da urologia, UTI e cirurgias plásticas. O segundo ano conta com cirurgia infantil, pronto socorro, cirurgia torácica e de cabeça e pescoço.